@TOME V2.2
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : GDC_HUMAN: (2015-12-08 )
MAAATAAAALAAADPPPAMPQAAGAGGPTTRRDFYWLRSFLAGGIAGCCAKTTVAPLDRVKVLLQAHNHHYKHLGVFSALRAVPQKEGFLGLYKGNGAMMIRIFPYGAIQFMAFEHYKTLITTKLGISGHVHRLMAGSMAGMTAVICTYPLDMVRVRLAFQVKGEHSYTGIIHAFKTIYAKEGGFFGFYRGLMPTILGMAPYAGVSFFTFGTLKSVGLSHAPTLLGRPSSDNPNVLVLKTHVNLLCGGVAGAIAQTISYPFDVTRRRMQLGTVLPEFEKCLTMRDTMKYVYGHHGIRKGLYRGLSLNYIRCIPSQAVAFTTYELMKQFFHLN

Atome Classification :

(20 SA) -----------------------------------.........10..------------------.-----.....20..---......30...--...----------.---------------.40----...--......50------.....--..--------.60.----..--...------.------.-------70---------..-.-----------..-...80.-------.......90----.........100....----------...110.......120..---------------..-----..--.130--.-.----.....-..-----140-....--....150-..----------------.------....----160-.---.--------.....170....-.-..180...---.-...190.-.---.....200.......210--........220...-----------------------...-.230....-----..--------..--240-.....-..-----..---------250..-.----......260--.....--.------..------.---270..-..-.-...280-.-------------......290.......300...--------....310--------........320..-.....330---------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -----------------------------------MAAATAAAALAAA------------------D-----PPPAMPQAA---GAGGPTTRRDF--YWL----------R---------------SF-----LAG--GIAGCCAK------TTVAP--LD--------RVKV----LL--QAH------N------H-------HY---------KH-L-----------GV-FSALRA-------VPQKEGFL-----GLYKGNGAMMIRIFPY----------GAIQFMAFEHYKTLITTK---------------LG-----IS--GH----V-H----RLMAG-SM-----AG--MTAV--ICTYPLD-MV----------------R------VRLA----FQV-K---G--------EHSYTGIIHAFK-T-IYAKEGGF---F-GFYRGLM-P---TILGMAPYAGVSFFTFG---TLKSVGLSHAPTLL-----------------------GRP-SSD-NPNV-----LV--------LK--T---HVNLL-CG-----GV---------A--GA-I----AQTISYP----FDVTR--R------RM------Q---L-GTV-LP-E-FEKCLT-M-------------RDTMKYVYGHHGIRKGLYRGLS--------LNYIRC---------IPSQAVAFTTYEL-MKQFFHLN---------------------
4 PsiBlast_PDB 79.8429% -78 - C5 -4C9Q ADT3_YEAST A:[30-305] ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NF-----LMG--GVSAAIAK------TAASP--IE--------RVKI----LI--QNQ------D------EMIKQGTLDK---------KY-S-----------GI-VDCFKR-------TAKQEGLI-----SFWRGNTANVIRYFPT----------QALNF-AFKDKIKLMFGF---------------KK-----E---GYGKWFA-G----NLASG-GA-----AG--ALSL--LFVYSLD-FA----------------R------TRLA----ADA-KS-----------ARQFNGLTDVYK-K-TL-KSDGI---A-GLYRGFM-P---SVVGIVVYRGLYFGMFD---SLK-------PL------------------------------------F-----L------------------ASFL-LG-----WV---------V--TT-G----ASTCSYP----LDTVR--R------RM------M---M-TS---G-Q-AVKYNG-A-------------IDCLKKIVASEGV-GSLFKGCG--------ANILRS---------VAGAGVISMYDQL-QMILFGK----------------------
9 HHSearch 79.7130% -79 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[2-293] -------------------------------------------------------------------------------------------DQAL--SFL----------K---------------DF-----LAG--GVAAAISK------TAVAP--IE--------RVKL----LL--QVQ------H------A-------SKQISAEK---QY-K-----------GI-IDCVVR-------IPKEQGFL-----SFWRGNLANVIRYFPT----------QALNFAFKDKYKQIFLGG---------------VDRHKQFWR--YF----A-G----NLASG-GA-----AG--ATSL--CFVYPLD-FA----------------R------TRLA----ADV-G---KGAA-----QREFTGLGNCIT-K-I-FKSDGL---R-GLYQGFN-V---SVQGIIIYRAAYFGVYD---TAKGMLPDPKN-----------------------------------------------------VH--I---IVSWM-IA-----QT---------V--TA-V----AGLVSYP----FDTVR--R------RM------M---M-QSG-RKGA-DIMYTG-T-------------VDCWRKIAKDEG-PKAFFKGAW--------SNVLRG---------MG-GAFVLVLYDE-I----------------------------
18 Fugue 78.4428% -78 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[2-293] -------------------------------------------------------------------------------------------DQAL--SFL----------K---------------DF-----LAG--GVAAAISK------TAVAP--IE--------RVKL----LL--QVQ------HASKQISA-------EK---------QY-K-----------GI-IDCVVR-------IPKEQGFL-----SFWRGNLANVIRYFPT----------QALNFAFKDKYKQIFLGG---------------VDRHKQFWR--YF----A-G----NLASG-GA-----AG--ATSL--CFVYPLD-FA----------------R------TRLA----ADV-GKGAA--------QREFTGLGNCIT-K-IFKSDG-L---R-GLYQGFN-V---SVQGIIIYRAAYFGVYD---TAKGMLPDPKNV-----------------------------------------------------H--I---IVSWM-IA-----QT---------V--TA-V----AGLVSYP----FDTVR--R------RM------M---MQSGR-KG-A-DIMYTG-T-------------VDCWRKIAKDEG-PKAFFKGAW--------SNVLRG---------MGGAFVLVLYDEI------------------------------
1 PsiBlast_PDB 77.7328% -82 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[8-293] ---------------------------------------------------------------------------------------------------L----------K---------------DF-----LAG--GVAAAISK------TAVAP--IE--------RVKL----LL--QVQHASKQIS------A-------EK---------QY-K-----------GI-IDCVVR-------IPKEQGFL-----SFWRGNLANVIRYFPT----------QALNFAFKDKYKQIFLGG---------------VD-----RH--KQ----F-W----RYFAG-NLASGGAAG--ATSL--CFVYPLD-FA----------------R------TRLA----ADVGK---GAA------QREFTGLGNCIT-K-IF-KSDGL---R-GLYQGFN-V---SVQGIIIYRAAYFGVYD---TAKGM---------------------------------LP-DPK-NVHI-----I------------------VSWM-IA-----QT---------V--TA-V----AGLVSYP----FDTVR--R------RM------M---M-QSG-RK-G-ADIMYTGT-------------VDCWRKIAKDEG-PKAFFKGAW--------SNVLRG---------MGG-AFVLVLYDE-I----------------------------
2 PsiBlast_PDB 76.9428% -81 - C5 -2C3E ADT1_BOVIN A:[8-293] ---------------------------------------------------------------------------------------------------L----------K---------------DF-----LAG--GVAAAISK------TAVAP--IE--------RVKL----LL--QVQHASKQIS------A-------EK---------QY-K-----------GI-IDCVVR-------IPKEQGFL-----SFWRGNLANVIRYFPT----------QALNFAFKDKYKQIFLGG---------------VD-----RH--KQ----F-W----RYFAG-NLASGGAAG--ATSL--CFVYPLD-FA----------------R------TRLA----ADVGK---GAA------QREFTGLGNCIT-K-IF-KSDGL---R-GLYQGFN-V---SVQGIIIYRAAYFGVYD---TAKGM---------------------------------LP-DPK-NVHI-----I------------------VSWM-IA-----QT---------V--TA-V----AGLVSYP----FDTVR--R------RM------M---M-QSG-RK-G-ADIMYTGT-------------VDCWRKIAKDEG-PKAFFKGAW--------SNVLRG---------MGG-AFVLVLYDE-I----------------------------
5 PsiBlast_PDB 71.1528% -81 - C5 -4C9H ADT2_YEAST A:[23-301] --------------------------------------------------------------------------------------------------FL----------I---------------DF-----LMG--GVSAAVAK------TAASP--IE--------RVKL----LI--QNQ------D------EMLKQGTLDR---------KY-A-----------GI-LDCFKR-------TATQEGVI-----SFWRGNTANVIRYFPT----------QALNFAFKDKIKAMFGFK----------------K-----EE--GY----A-KWFAGNLASG-GA-----AG--ALSL--LFVYSLD-YA----------------R------TRLA----ADS--------------ARQFNGLIDVYK-K-TL-KSDGV---A-GLYRGFL-P---SVVGIVVYRGLYFGMYD---SLK---------------------------------------------------L------------------ASFL-LG-----WV---------V--TT-G----ASTCSYP----LDTVR--R------RM------M---M-TS---G-Q-AVKYDG-A-------------FDCLRKIVAAEGV-GSLFKGCG--------ANILRG---------VAGAGVISMYDQL-QMILFGKK---------------------
3 PsiBlast_PDB 70.5629% -74 - C5 -4C9J ADT3_YEAST A:[30-305] ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NF-----LMG--GVSAAIAK------TAASP--IE--------RVKI----LI--QNQ------D------EMIKQGTLDK---------KY-S-----------GI-VDCFKR-------TAKQEGLI-----SFWRGNTANVIRYFPT----------QALNF-AFKDKIKLMFGF---------------KK-----EE--GYGKWFA-G----NLASG-GA-----AG--ALSL--LFVYSLD-FA----------------R------TRLA----ADA-KS-----------ARQFNGLTDVYK-K-TL-KSDGI---A-GLYRGFM-P---SVVGIVVYRGLYFGMFD---SLK------------------------------------------------------------------------FL-LG-----WV---------V--TT-G----ASTCSYP----LDTVR--R------RM------M---M-TS---G-Q-AVKYNG-A-------------IDCLKKIVASEGV-GSLFKGCG--------ANILRS---------VAGAGVISMYDQL-QMILFGKK---------------------
22 Fugue 65.4017%-105 - C1 -4WID ? A:[10-362] -----------------------------KDMALQHAVDLLEKMLADEEKLTEFNLGDPLFESANDD-----PIKTLEEII---QEGDDVVGAHQ--LVVTQIKLRVQRNR---------------RL-----ADE--IIREQLTD------IRKVF--SD--------KFEK----LE--QGI------Q------N-------SY---------LL-LDKLKTPFQDMRCL-FEVANE-------QFNDTPVP-----PQYKEFMVCLKQIVQY----------AVNS-SSLEKFVMLITKK---------------DD-----IK--DR----VTY----TCMKY-LL-----MA--MQGT--GGPKAINNEE----------------H------AKLF----FQL-S---N--------YDDLTDANHDGL-E-LIKKLDKE---Q-KEVAFHV-N---NFTHLVTTLGMALYKEG---HQKNDEAMLGM----------------------------------HTPI-----TM--------LS--D---QVRVL-IL-----YL---------I--DE-I----VHAIHTN----SNQSN--D------ELIDGLKPK---V-RIV-IN-E-FHATLM-M-------------GIDKMKFY-------------S--------LNELRE---------IVNDKI-------------------------------------
23 Fugue 62.4315% -73 - C3 -3PVT PAAA_ECOLI A:[1-304] -----------------------------MRSTQEERFEQRIAQETAI------------------E-----PQDWMP--D---AYRKTLIRQIG--QHA----------H---------------SE-----IVG--MLPEGNWI------TRAPT--LR--------RKAI----LL--AKV------Q------D-------EA---------GHGL-----------YL-YSAAET-------LGC---------------AREDIYQKMLD----------GRMKYSSIFNYPTLSWAD---------------IG-----VI--GW----L-V----DGAAI-VN-----QVALCRTS--YGPYARA-MV----------------K------ICKE----ESF-H---Q--------RQGFEACMALAQGS-EAQKQMLQ---D-AINRFWW-P---ALMMFGPNDDNS---------------PNSARSL-----------------------TWK-IKR-FTND-----EL--------RQ--R---FVDNT-VP-----QV---------EMLGM-T----VPDPDLH----FDTES--G------HY------R---F-GEIDWQ-E-FNEVIN-----------------------GRGICNQERLDAKR--------KAWEEG---------TWVREAALAHAQK------------------------------
26 Fugue 59.1414% -87 * C4 *4US5 ? A:[4-338] --------------------------------HVKLSVVEQAPVVEGL------------------T-----PAHSLQHSI---ELARLADRLGYERFWV----------A---------------EHHAEIFNAV--PAPEILIA------RIAAE--TS--------GIRVGSGGVL--LSL------Y------S-------PL---------KV-A-----------EV-FRTLHA-------LYPDRIDL-----GIGRANRVKLPVFAALR---------DDSSDDLWRRLEQLRAYL---------------DP-----DS--GL----P-F----TVSPRMPG-----GP--ALWL--LGA---S-VS----------------S------AEAA----ARL-------------------GLPYAYA-HFITPQFTRE---AMDTYRAAFVP---GPDTPSPRPILSVVVCCAETDAEAQRVYATHRLF-----------------------HRRMSQG-DVRL-----LP--------PA--D---LAVAEMDK-----PG---------P--DP-L----AEE---------SFEW--P------RY------V---V-GSP-DR-V-RDQLTKMA-------------DAT----------------GAE--------ELGVVSM--------IHDQRDRLRSYRL-LAEAFELTPR-------------------
8 HHSearch 57.6926% -67 - C5 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[14-300] ---------------------------------------------------------------------------------------------------T----------V---------------KF-----LGA--GTAACIAD------LITFP--LD--------TAKV----RL--QIQ------G------E-------SQGLVRTAASAQY-R-----------GV-LGTILT-------MVRTEGPR-----SLYNGLVAGLQRQMSF----------ASVRIGLYDSVKQFYTKG---------------SE-----HA--GI----G-S----RLLAG-ST-----TG--ALAV--AVAQPTD-VV----------------K------VRFQ----AQA-R---AGG------GRRYQSTVEAYK-T-I-AREEGI---R-GLWKGTS-P---NVARNAIVNCAELVTYD---LIKDTLLKANLMT---------------------------------------------------DD--L---PCHFT-SA-----FG---------A--GF-C----TTVIASP----VDVVK--T------RY------M---N-SAL-G------QYHS-A-------------GHCALTMLRKEG-PRAFYKGFM--------PSFLRL---------GSWNVVMFVTYEQ-LKRALMAA---------------------
6 PsiBlast_PDB 57.4826% -70 - C5 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[17-296] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------F-----LGA--GTAACIAD------LITFP--LD--------TAKV----RL--QIQ------G------E-------SQGLVRTAASAQY-R-----------GV-LGTILT-------MVRTEGPR-----SLYNGLVAGLQRQMSF----------ASVRIGLYDSVKQFYTKG---------------SE-----HA--GI----G-S----RLLAG-ST-----TG--ALAV--AVAQPTD-VV----------------K------VRFQ----AQA-RAG-G--------GRRYQSTVEAYK-T-I-AREEGI---R-GLWKGTS-P---NVARNAIVNCAELVTYD---LIKD-------TLL-------------------------------KANL-----MT--------DD--L---PCHFT-SA-----FG---------A--GF-C----TTVIASP----VDVVK--T------RY----------M-NSA-LG-Q-YHSAGH-C-------------ALTMLRKEGP----RAFYKGFM--------PSFLRL---------GSWNVVMFVTYEQ-LKRALMAA---------------------
11 HHSearch 56.6724% -73 - C5 -1OKC ADT1_BOVIN A:[5-202] ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------L--SF----L-K----DFLAG-GV-----AA--AISK--TAVAPIE-RV----------------K------LLLQ----VQH-A---SKQISA---EKQYKGIIDCVV-R-I-PKEQGF---L-SFWRGNL-A---NVIRYFPTQALNFAFKD---KYKQIFLGGVDRHK----------------------------------Q-----FW--------RY--F---AGNLA-SG-----GA---------A--GA-T----SLCFVYP----LDFAR--T------RL------A---A-DVG-KG-AAQREFTG-L-------------GNCITKIFKSDG-LRGLYQGFN--------VSVQGI---------IIYRAAYFGVYDT-AKGMLPDP---------------------
19 Fugue 56.6518% -81 * C3 *4PXG - T2S3_STAAU A:[26-509] -----------TKQAVHNRAKEAVGKSVLELNGGESIKSSVGDAFENWFG----------------V-----ALKATPFKK---LKNGKYSSKER--LVL----------NIINYEKVANENFETSSF-----LSKNNTIELAFYEYIKGTPSDNWI--IK--------EAVL----YEM-HKN------P------I-------DY---------EI-I-----------KQDWEIINQ-------YINEGKAH-----ELSEGLTSYLAPCTKG----------ANASSLRNQPYSDIKAKQ---------------RA-----FSLKSG----YMT----SILRK-YV-----LG--DEKIDSIVKDPFE-IK----------------EKSIEDIVFEK----FQP-Y---I--------NWSIDKLCEHFS-I-NKGEKGLN---Y-RIASAIL-NLKGKTTKSKPFPEVEEFEKSSI-VVKTVHFNKKNVNKESMSFGAFKFEELANEEWEDSE-GYP-SAQ-WRNF-----LLETRFLFFVVK--EDEDGVDIF-KG-----IK---------F--FSMP----EEDINGPVKRMWDDTV--K------KL------K---E-GVT-LE-A-VPDKST-KDGWRIKNNFVDKSDDLICHVRPHTNNRD--YRGGSNADKLPKKINWINR---------PDSDDY---SDEWMTKQSFWINNDYIKKQVEDLL---------
21 Fugue 56.2215% -79 - C2 -4K6L ? G:[1-224] ----------------------------------------VDFVYRVD------------------S-----TPPDVIFRD---GFSLLGYNRN-----F----------Q---------------QF-----ISG--RSCSGGSSDSRYI-ATTSS--VN--------QTYA----IA--RAY------Y------S-------RS---------TF-K-----------GN-LYRYQI-------RADNN---------FYS----------LL----------PSITYLETQ--------------------------------G--GH----F-N----AYEKT-MM-----RL--QREY--VSTLSIL-PE----------------N------IQKA----VAL-V---Y--------D-SATGLVKDGV-S-TMN----------------------------------------------------ASYL-----------------------GLS-TTS-NPGV-----IP--------F-----------------------------------------------LP----EPQTY--T------QQ------R---I-DAF-GP-L-ISSCFS-I-------------GSVC---HSHRGQRADVY---N--------MSFYDA---------RPVIELILSK---------------------------------
27 Fugue 56.2016% -73 - C4 -4NNB - ? A:[4-527] TSLYITAAPIGAVPKFLDPFEATFIPSFLLEGFFDADRCASIAADLKT------------------DGWEVVPAGGRLLQV---GHAQPIAHFPK--PWL----------A---------------AL-----SNK--LARRIVLQ------LTTYGWIVS--------EQGD----LLWEHER------Q------H-------HY---------LP-P-----------AL-IEAIEKESPALLKNMEEAGWI-----ACAAGYWQAGKARSPYLPITPEAITEETIRSMRAGAAVVHLHTRDLSDRRRIEIPGLGVVT-----VG--SQ----R-N----QIVLD-DY-----DA--IVPM--VKKREPA-AILNLSTSVRGDRHGARSK------LRRAHLKFYDD-V---G--------SAPEVASLSPAA-V-VFQGGGGYDNAP-DFLDAQF-D---HFERVGTRPEVEVFNHA---IVDNATSLYRDRLLRTGKPVLFMLVAGVDQYRRDPITGEV-EDD-SLIA-----RV--------VR--E---EISSL-LADESADSH---------R--RA-V----ELAIGQL----RPVVE--RLRASFPVS------K---I-SIL-LP-G-PMQNLL-V-------------DVALGL--GLDGIRVGLEDGLT--------VNDARV---------PGGVRKARGTWEQ-VSLVREELLGRGATILTAAQVRDMFGLGI
25 Fugue 55.8816% -69 - C4 -4NZR Y281_MYCGE M:[26-416] ---------------NDGSYQSEIDLSGGANFREKFRNFANELSEAIT------------------N-----SPKGLDRPVPKTEISGLIKTGDN--FIT----------P---------------SF-----KAG--YYDHVASD------GSLLS--YYQSTEYFNNRVLMP---IL--QTT------NGT----L-------MA---------NN-R-----------GY-DDVFRQ-------VPSFSGWSNTKATTVSTSNNLTYDKWTYF----------AAKGSPLYDSYPNHFFED----------------------------------V----KTLAI-DA-----KD--ISAL--KTTIDSE-KP----------------T------YLII----RGL-S---G--------NGSQLNELQLPE-S-V--KKVSL---Y-GDYTGVN-V---AKQIFANVVELEFYSTS---KANSFGFN--PLVL-----------------------GSK-TNV-IYDL-----FA--------SKPFT---HIDLT-QV-----TLQNSDNSAIDA--NK-L----KQAVGDI----YNYRRFER------QF------QGYFA-GGY-ID-K-YLVKNV-NTNKDSDD------DLVYRSLKELNLHLEEAYREGD--------NTYYRVNENYYPGASIYENERASRDSEF-QNEILKR----------------------
10 HHSearch 39.6623% -59 - C5 -2LCK - UCP2_MOUSE A:[15-205] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------V----KFLGA-GT-----AA--CIAD--LITFPLD-TA----------------K------VRLQ----IQG-E---SQGLVRTAASAQYRGVLGTIL-T-M-VRTEGP---R-SLYNGLV-A---GLQRQMSFASVRIGLYD---SVKQFYTKGSE--------------------------------------------H--------AG--I---GSRLL-AG-----ST---------T--GA-L----AVAVAQP----TDVVK--V------RF------Q---A-QAR-AG-G-GRRYQS-T-------------VEAYKTIAREEG-IRGLWKGTS--------PNVARN---------AIVNCAELVTYDL-IKDTLLKA---------------------
7 PsiBlast_PDB 28.7030% -4 - C5 -3PMI MUM1_HUMAN A:[54-125] ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SLK---SLKHFDCKEKQTLL-----------------------NQA-REDFNQDIGWCVSLI--------TD--Y---RVRLG-CG-----SF---------A--GS-FLEYYAADISYP----VRKSI--Q------QD------V---L-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
20 Fugue 23.9329% 242 - C5 -4UI9 - ? U:[1-24] --------------------------------------MSRRPCSCAL------------------R-----PPAAAAAAA---AAAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------